Клещевой энцефалит (весенне-летний). Вирус энцефалита, попадая в желудок клеща, проникает затем во все органы клеща и скапливается в слюнных железах, яичниках и яйцеклетках. Вследствие этого возбудители заболевания передаются клещом потомству трансвариально и распространяются среди животных-хозяев. Клещевой энцефалит имеет определенную очаговость, связанную с распространением клещей, а также сезонность, зависящую от времени выплода и наибольшей активности клещей. В организме человека вирусы клещевого энцефалита распространяются гематогенно.

Входными воротами инфекции являются поверхностные кровеносные сосуды, из которых вирус попадает во внутренние органы и нервную систему.